目前，常用的消毒方法多采用物理方法(如干热法、湿热法、过滤法、射线法等)和化学方法(消毒剂、抗生素)两大类。
是利用恒温干燥箱内160℃～170℃的高热，并保持90～120分钟，杀死细菌和芽孢，达到目的的一种方法。主要适用于不便在压力蒸汽器中进行，且不易被高温损坏的玻璃器皿、金属器械以及不能和蒸汽接触的物品的。用此方法的物品干燥，易于贮存。酒精灯火焰烧灼法也是属于干热的方法之一，在进行微生物检测工作时，常须利用工作台面上的酒精灯火焰对金属器具及玻璃器皿口缘进行补充。
压力蒸汽湿热法是目前常用的一种方法。它利用高压蒸汽以及在蒸汽环境中存在的潜热作用和良好的穿透力，使菌体蛋白质凝固变性而使微生物死亡。适合于布类工作衣、各种器皿、金属器械、胶塞、蒸馏水、棉塞、纸和培养基的。高压蒸汽器的蒸汽压力一般调整为0.10-0.11MPa，维持20～30min即可达到效果。
利用紫外线灯进行照射的方法。紫外线是一种低能量的电磁辐射，可以杀灭多种微生物。紫外线的作用机制是通过对微生物的核酸及蛋白质等的破坏作用而使其灭活。适合于实验室空气、地面、操作台面。时间为30min。用紫外线时应注意，不能边照射边进行实验操作，因为紫外线不仅对人体皮肤有伤害，而且对培养物及一些试剂等也会产生不良影响。
4.过滤法
是将液体或气体通过有微孔的滤膜过滤，使大于滤膜孔径的细菌等微生物颗粒阻留，从而达到的方法。过滤法大多用于遇热易发生分解、变性而失效的试剂、酶液、血清、培养基等。
二、不同种类物品及培养物的消毒方法
1.无菌操作室
由于无菌操作室的污染来源主要是空气中的细菌和真菌孢子，因此长期停用后的无菌操作室应进行熏蒸，熏蒸是用高锰酸钾+甲醛[(2mL甲醛+1g高锰酸钾)/m3]进行无菌室的。经常使用的无菌操作室，在每次使用前都应进行地面卫生清洁，并用紫外线灯照射30min，进行空气。对超净工作台，每次操作前用紫外灯照射30min，然后用70%～75%酒精擦拭。
2.培养液
培养液在制备过程中带有各种杂菌，分装后应立即，至少也应在4小时内完成工序。目前常用过滤法除去培养物操作液和培养液中的细菌。或对培养液中耐热组分先进行高压蒸汽，然后在无菌室加入经过过滤的不耐热溶液，混匀后分装备用。
在121℃的蒸汽温度下可以很快杀死各种细菌及高度耐热的芽孢杆菌，因此许多培养液的消毒压力、温度一般保持在0.10~0.11MPa、121℃。消毒时间与需要消毒的培养液量密切相关(表1)，时间不足达不到效果，时间过长培养液内的一些化学物质遭到破坏，影响培养液成分。消毒结束后，关闭热源，只有当器内压力降为零时才能打开放气阀，排除剩余蒸汽，取出培养液。不可在压力较高时打开放气阀，引起减压沸腾，使容器中液体溢出。培养液组成中如含有遇热易分解的物质，则需用过滤方法消毒。首先对培养液中耐热组分进行高压蒸汽后放置在无菌场所，固体培养液在40℃左右琼脂即将凝结前，加入经过过滤的不耐热溶液，混匀后冷却备用。
表1 培养基高压蒸汽所必需的少时间
玻璃器皿可进行干热或高压蒸汽，但在蒸汽后及时烘干水分。对不能进行高压蒸汽的塑料器皿可用75%酒精浸泡，使用前在无菌操作台面上晾干的同时，用紫外线重复。实验室还可以用环氧乙烷袋对塑料器皿进行消毒，消毒后的器皿要充分散气2～4小时后才可使用。无菌操作所用的各种器械，一般采用干热或高压蒸汽，或用75%酒精浸泡，然后在无菌操作台面上晾干的同时再用紫外线重复；在使用期间可多次对其进行酒精灯火焰灼烧。
4.培养材料的消毒
采自动物机体的实验材料，携带着微生物及杂质，接种前须进行表面消毒，对内部已受微生物侵染的材料应予以淘汰。从动物机体采集的某些组织块，须用消毒剂进行浸泡处理，进行表面消毒。常用消毒剂有过氧化氢(10~12%，浸泡5~15 min)、过氧乙酸(0.05%，浸泡30s~1min)、酒精(70~75%，浸泡2 min)。
表3 实验中常用物品的消毒方法选择
三、程序验证内容
确认设备技术资料齐全、安装正确，并能处于正常运行。
采用被物品或模拟物品进行重复实验确认效果符合规定。
四、程序运行监控
程序定期验证，时效不超过半年。
五、保证
冷却阶段防止已物品再次污染。
六、生物指示剂
菌种的耐受性应大于需产品中所有可能污染菌的耐受性。
菌株应稳定，存活期长，易于保存。
七、常用生物指示剂
干热：枯草芽孢杆菌孢子（ATCC9372等，活孢子数为5×105～5×106个/片)。
八、小结
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